EENdb - TALEN/ZFN > Chromosome View

EENs targeting zebrafish Chromosome 7

2 MbTALENsZFNsCRISPR/CasCurrently centered EEN (TN0164)


EEN IDSpecies & LocusRef.LocationLocation detailDistanceEffic.NotesCentering
TN0164 zebrafish, ryr1a G 22916025 R 21,510,420 7:21510388-21510453:+ 0 Multi-mapping(Centered)
ZN0017-T013 zebrafish, sox6, intron G 20843781 R 28,400,973 7:28400961-28400986:+ +6.9 Mb Low C
ZN0016 zebrafish, ntla G 18500334 R 33,480,745 7:33480732-33480758:- +12.0 Mb C
TN0153 zebrafish, hif1ab G 22684503 R 39,970,120 7:39970095-39970146:+ +18.5 Mb No C
TN0154 zebrafish, ptpmt1 G 22684503 R 39,970,423 7:39970397-39970449:+ +18.5 Mb No C
TN0155 zebrafish, ptpmt1 G 22684503 R 39,971,275 7:39971249-39971301:+ +18.5 Mb C
TN0168 zebrafish, ppp1cab G 23000899 R 45,446,095 7:45446069-45446121:+ +23.9 Mb C
ZN0191 zebrafish, hey2 G 22543349 R 53,609,888 7:53609872-53609904:+ +32.1 Mb Low C



Legends
Currently centered EEN
Multiple designed target site of the centered EEN
EEN reported with low or no activity
123 bpEEN with a distance <1 kb to the centered EEN
-45.6 kbEEN with a distance 1 kb - 1 Mb to the centered EEN
78.9 MbEEN with a distance >1 Mb to the centered EEN
GSearch EENdb with this gene symbol
RSearch EENdb with this reference
CCenter with this EEN

©2012-2013  PKU Zebrafish Functional Genomics Group
School of Life Sciences, Peking University, Beijing, China
Reference of EENdb    Contact us