EENdb - TALEN/ZFN > Chromosome View

EENs targeting zebrafish Chromosome 4

2 MbTALENsZFNsCRISPR/CasCurrently centered EEN (ZN0202)


EEN IDSpecies & LocusRef.LocationLocation detailDistanceEffic.NotesCentering
ZN0202 zebrafish, myod1 G 22655075 R 5,854,232 4:5854219-5854245:- 0 (Centered)
ZN0104 zebrafish, apoeb G 21151135 R 10,484,562 4:10484550-10484575:+ +4.6 Mb C
ZN0150 zebrafish, ago2 G 21937602 R 11,151,252 4:11151239-11151265:+ +5.3 Mb Low C
ZN0106 zebrafish, grip1, intron G 21151135 R 12,184,674 4:12184662-12184686:+ +6.3 Mb C
TN5007 zebrafish, dre-mir-126, flanking G Zhang Group 14,039,426 4:14039403-14039449:+ +8.2 Mb No C
ZN0017-T008 zebrafish, tmpoa G 20843781 R 15,926,510 4:15926498-15926522:+ +10.1 Mb Low C
TN5004 zebrafish, sema3fb G Zhang Group 18,634,789 4:18634767-18634811:+ +12.8 Mb No C
ZN0162 zebrafish, gata3 G 21937602 R 24,147,359 4:24147347-24147372:+ +18.3 Mb C



Legends
Currently centered EEN
Multiple designed target site of the centered EEN
EEN reported with low or no activity
123 bpEEN with a distance <1 kb to the centered EEN
-45.6 kbEEN with a distance 1 kb - 1 Mb to the centered EEN
78.9 MbEEN with a distance >1 Mb to the centered EEN
GSearch EENdb with this gene symbol
RSearch EENdb with this reference
CCenter with this EEN

©2012-2013  PKU Zebrafish Functional Genomics Group
School of Life Sciences, Peking University, Beijing, China
Reference of EENdb    Contact us