EENdb - TALEN/ZFN > Chromosome View

EENs targeting zebrafish Chromosome 2

2 MbTALENsZFNsCRISPR/CasCurrently centered EEN (TN0169)


EEN IDSpecies & LocusRef.LocationLocation detailDistanceEffic.NotesCentering
TN0169 zebrafish, cdh5 G 23000899 R 2,745,044 2:2745015-2745074:+ 0 (Centered)
ZN0192 zebrafish, rock1 G 22543349 R 3,032,079 2:3032067-3032092:+ +287.0 kb No C
TN5022 zebrafish, adprhl1 G Zhang Group 22,313,481 2:22313456-22313507:+ +19.6 Mb No C
ZN0194 zebrafish, dclk2 G 22543349 R 28,100,909 2:28100893-28100925:+ +25.4 Mb Multi-mappingC
ZN0017-T017 zebrafish, adcyap1b, 3'-UTR G 20843781 R 31,013,826 2:31013814-31013839:+ +28.3 Mb Low C
TN5009 zebrafish, acvr1l G Zhang Group 41,572,852 2:41572828-41572877:- +38.8 Mb No C
TN5008 zebrafish, smo G Zhang Group 41,573,321 2:41573297-41573346:- +38.8 Mb No C
TN5014 zebrafish, G Zhang Group 42,847,783 2:42847756-42847811:+ +40.1 Mb No C
ZN0017-T014 zebrafish, -, intron G 20843781 R 49,357,865 2:49357853-49357878:+ +46.6 Mb Low C



Legends
Currently centered EEN
Multiple designed target site of the centered EEN
EEN reported with low or no activity
123 bpEEN with a distance <1 kb to the centered EEN
-45.6 kbEEN with a distance 1 kb - 1 Mb to the centered EEN
78.9 MbEEN with a distance >1 Mb to the centered EEN
GSearch EENdb with this gene symbol
RSearch EENdb with this reference
CCenter with this EEN

©2012-2013  PKU Zebrafish Functional Genomics Group
School of Life Sciences, Peking University, Beijing, China
Reference of EENdb    Contact us