EENdb - TALEN/ZFN > Chromosome View

EENs targeting zebrafish Chromosome 1

2 MbTALENsZFNsCRISPR/CasCurrently centered EEN (TN5021)


EEN IDSpecies & LocusRef.LocationLocation detailDistanceEffic.NotesCentering
TN5021 zebrafish, dusp5 G Zhang Group 77,785 1:77759-77812:- 0 Low (Centered)
ZN0017-T005 zebrafish, fhdc1 G 20843781 R 24,258,849 1:24258837-24258861:+ +24.2 Mb Low C
ZN0199 zebrafish, lepr, exon-intron G 22543349 R 28,144,867 1:28144851-28144883:+ +28.1 Mb Low C
ZN0017-T015 zebrafish, (intergenic) G 20843781 R 31,442,419 1:31442407-31442431:+ +31.4 Mb Low C
ZN0193 zebrafish, zgc:77041, exon-intron G 22543349 R 37,046,229 1:37046214-37046245:+ +37.0 Mb C
ZN0017-T018 zebrafish, - G 20843781 R 43,417,407 1:43417394-43417420:+ +43.3 Mb Low C
ZN0017-T010 zebrafish, (intergenic) G 20843781 R 57,642,189 1:57642176-57642202:- +57.6 Mb Low Multi-sitesC



Legends
Currently centered EEN
Multiple designed target site of the centered EEN
EEN reported with low or no activity
123 bpEEN with a distance <1 kb to the centered EEN
-45.6 kbEEN with a distance 1 kb - 1 Mb to the centered EEN
78.9 MbEEN with a distance >1 Mb to the centered EEN
GSearch EENdb with this gene symbol
RSearch EENdb with this reference
CCenter with this EEN

©2012-2013  PKU Zebrafish Functional Genomics Group
School of Life Sciences, Peking University, Beijing, China
Reference of EENdb    Contact us