EENdb - TALEN/ZFN > Chromosome View

EENs targeting zebrafish Chromosome 19

2 MbTALENsZFNsCRISPR/CasCurrently centered EEN (TN0147)


EEN IDSpecies & LocusRef.LocationLocation detailDistanceEffic.NotesCentering
ZN0034 zebrafish, tert G 19198653 R 615,619 19:615607-615632:+ -34.8 Mb C
ZN0151 zebrafish, arhgef1 G 21937602 R 11,556,828 19:11556816-11556841:+ -23.9 Mb Low C
CN0006 zebrafish, apoea G 23360964 R 11,958,342 19:11958326-11958345:- -23.5 Mb C
TN5013 zebrafish, slc22a17 G Zhang Group 29,784,651 19:29784626-29784677:- -5.6 Mb No Multi-mappingC
ZN0014 zebrafish, slc24a5 G 18500334 R 30,637,309 19:30637293-30637325:- -4.8 Mb C
TN0147 zebrafish, jak3 G 22655075 R 35,411,589 19:35411563-35411615:- 0 (Centered)
ZN0142 zebrafish, gria3a G 21822241 R 42,466,480 19:42466468-42466493:+ +7.1 Mb C
ZN0174 zebrafish, spon1b G 21937602 R 45,186,639 19:45186626-45186652:+ +9.8 Mb No C



Legends
Currently centered EEN
Multiple designed target site of the centered EEN
EEN reported with low or no activity
123 bpEEN with a distance <1 kb to the centered EEN
-45.6 kbEEN with a distance 1 kb - 1 Mb to the centered EEN
78.9 MbEEN with a distance >1 Mb to the centered EEN
GSearch EENdb with this gene symbol
RSearch EENdb with this reference
CCenter with this EEN

©2012-2013  PKU Zebrafish Functional Genomics Group
School of Life Sciences, Peking University, Beijing, China
Reference of EENdb    Contact us