EENdb - TALEN/ZFN > Chromosome View

EENs targeting zebrafish Chromosome 25

2 MbTALENsZFNsCRISPR/CasCurrently centered EEN (TN0145)


EEN IDSpecies & LocusRef.LocationLocation detailDistanceEffic.NotesCentering
CN0008 zebrafish, tph1a G 23360964 R 8,415,692 25:8415676-8415695:+ -23.9 Mb C
ZN0017-T020 zebrafish, myo5aa G 20843781 R 9,239,869 25:9239856-9239882:- -23.0 Mb Low C
ZN0171 zebrafish, ptpru G 21937602 R 16,136,253 25:16136240-16136266:- -16.1 Mb Low C
CN0005 zebrafish, th1 G 23360964 R 24,796,458 25:24796442-24796461:- -7.5 Mb C
TN0145 zebrafish, phf6 G 22655075 R 32,266,401 25:32266374-32266428:- 0 (Centered)
ZN0200 zebrafish, zgc:56306 G 22543349 R 32,266,401 25:32266389-32266414:- 0 Low (Centered)



Legends
Currently centered EEN
Multiple designed target site of the centered EEN
EEN reported with low or no activity
123 bpEEN with a distance <1 kb to the centered EEN
-45.6 kbEEN with a distance 1 kb - 1 Mb to the centered EEN
78.9 MbEEN with a distance >1 Mb to the centered EEN
GSearch EENdb with this gene symbol
RSearch EENdb with this reference
CCenter with this EEN

©2012-2013  PKU Zebrafish Functional Genomics Group
School of Life Sciences, Peking University, Beijing, China
Reference of EENdb    Contact us