EENdb - TALEN/ZFN > Chromosome View

EENs targeting human Chromosome 9

10 MbTALENsZFNsCRISPR/CasCurrently centered EEN (TN0136)


EEN IDSpecies & LocusRef.LocationLocation detailDistanceEffic.NotesCentering
TN0093 human, JAK2, ATG G 22484455 R 5,021,997 9:5021971-5022023:+ -95.4 Mb C
ZN0113 human, CDKN2A G 21191366 R 21,971,111 9:21971096-21971127:- -78.5 Mb C
ZN0112 human, CDKN2A G 21191366 R 21,971,184 9:21971169-21971200:- -78.5 Mb C
TN0074 human, FANCG, ATG G 22484455 R 35,079,506 9:35079481-35079531:- -65.4 Mb C
ZN0116 human, CLTA G 21297641 R 36,211,765 9:36211743-36211787:+ -64.2 Mb Multi-sitesC
TN0071 human, FANCC, ATG G 22484455 R 98,011,580 9:98011554-98011606:- -2.4 Mb C
TN0113 human, PTCH1, ATG G 22484455 R 98,279,078 9:98279054-98279102:- -2.2 Mb C
TN0136 human, XPA, ATG G 22484455 R 100,459,559 9:100459533-100459585:- 0 (Centered)
TN0042 human, ABL1, ATG G 22484455 R 133,589,717 9:133589691-133589743:+ +33.1 Mb C



Legends
Currently centered EEN
Multiple designed target site of the centered EEN
EEN reported with low or no activity
123 bpEEN with a distance <1 kb to the centered EEN
-45.6 kbEEN with a distance 1 kb - 1 Mb to the centered EEN
78.9 MbEEN with a distance >1 Mb to the centered EEN
GSearch EENdb with this gene symbol
RSearch EENdb with this reference
CCenter with this EEN

©2012-2013  PKU Zebrafish Functional Genomics Group
School of Life Sciences, Peking University, Beijing, China
Reference of EENdb    Contact us