EENdb - TALEN/ZFN > Chromosome View

EENs targeting human Chromosome 6

10 MbTALENsZFNsCRISPR/CasCurrently centered EEN (TN0082)


EEN IDSpecies & LocusRef.LocationLocation detailDistanceEffic.NotesCentering
TN0029 human, POU5F1, 3'-UTR G 21738127 R 31,132,378 6:31132351-31132406:- -77.8 Mb Multi-mappingC
ZN0060 human, POU5F1, intron G 19680244 R 31,134,028 6:31134009-31134047:- -77.7 Mb C
ZN0058 human, POU5F1, intron G 19680244 R 31,137,889 6:31137869-31137910:- -77.7 Mb C
TN0028 human, POU5F1, intron G 21738127 R 31,137,898 6:31137873-31137924:- -77.7 Mb C
ZN0059 human, POU5F1, intron G 19680244 R 31,137,899 6:31137879-31137920:- -77.7 Mb C
TN0072 human, FANCE, ATG G 22484455 R 35,420,340 6:35420314-35420367:+ -73.5 Mb No C
ZN0023 human, VEGFA, 5'-up G 18657511 R 43,737,430 6:43737417-43737443:+ -65.1 Mb C
ZN0219 human, VEGFA G 23028823 R 43,738,499 6:43738486-43738512:+ -65.1 Mb C
TN0082 human, FOXO3 G 22484455 R 108,882,472 6:108882445-108882499:+ 0 (Centered)
TN0085 human, HDAC2 G 22484455 R 114,292,327 6:114292300-114292354:- +5.4 Mb C



Legends
Currently centered EEN
Multiple designed target site of the centered EEN
EEN reported with low or no activity
123 bpEEN with a distance <1 kb to the centered EEN
-45.6 kbEEN with a distance 1 kb - 1 Mb to the centered EEN
78.9 MbEEN with a distance >1 Mb to the centered EEN
GSearch EENdb with this gene symbol
RSearch EENdb with this reference
CCenter with this EEN

©2012-2013  PKU Zebrafish Functional Genomics Group
School of Life Sciences, Peking University, Beijing, China
Reference of EENdb    Contact us