EENdb - TALEN/ZFN > Chromosome View

EENs targeting human Chromosome 1

10 MbTALENsZFNsCRISPR/CasCurrently centered EEN (TN0056)


EEN IDSpecies & LocusRef.LocationLocation detailDistanceEffic.NotesCentering
TN0122 human, SDHB G 22484455 R 17,380,470 1:17380444-17380496:- -175.7 Mb C
TN0084 human, HDAC1, ATG G 22484455 R 32,757,798 1:32757772-32757824:+ -160.3 Mb Multi-mappingC
TN0103 human, MYCL1, ATG G 22484455 R 40,367,098 1:40367072-40367124:- -152.7 Mb C
TN0101 human, MUTYH, ATG G 22484455 R 45,805,915 1:45805888-45805942:- -147.3 Mb C
TN0125 human, SETDB1, ATG G 22484455 R 150,900,201 1:150900175-150900227:+ -42.2 Mb C
TN0108 human, NTRK1, ATG G 22484455 R 156,785,641 1:156785615-156785667:+ -36.3 Mb No C
TN0123 human, SDHC G 22484455 R 161,284,233 1:161284206-161284260:+ -31.8 Mb C
TN0120 human, RNF2, ATG G 22484455 R 185,056,696 1:185056670-185056722:+ -8.0 Mb No C
TN0056 human, CDC73 G 22484455 R 193,091,367 1:193091341-193091393:+ 0 (Centered)
ZN0061-T002 human, PKP1, intron G 19680244 R 201,281,293 1:201281275-201281312:+ +8.2 Mb Low C
TN0116 human, RBBP5 G 22484455 R 205,090,963 1:205090937-205090989:- +12.0 Mb C
ZN0201 human, GALNT2, exon-intron G 22566642 R 230,371,853 1:230371831-230371875:+ +37.3 Mb C
TN0077 human, FH, ATG G 22484455 R 241,682,995 1:241682969-241683022:- +48.6 Mb C



Legends
Currently centered EEN
Multiple designed target site of the centered EEN
EEN reported with low or no activity
123 bpEEN with a distance <1 kb to the centered EEN
-45.6 kbEEN with a distance 1 kb - 1 Mb to the centered EEN
78.9 MbEEN with a distance >1 Mb to the centered EEN
GSearch EENdb with this gene symbol
RSearch EENdb with this reference
CCenter with this EEN

©2012-2013  PKU Zebrafish Functional Genomics Group
School of Life Sciences, Peking University, Beijing, China
Reference of EENdb    Contact us