EENdb - TALEN/ZFN > Chromosome View

EENs targeting zebrafish Chromosome 5

2 MbTALENsZFNsCRISPR/CasCurrently centered EEN (TN0033)


EEN IDSpecies & LocusRef.LocationLocation detailDistanceEffic.NotesCentering
ZN0017-T004 zebrafish, (intergenic) G 20843781 R 15,562,206 5:15562193-15562219:- -9.5 Mb Low C
TN0166 zebrafish, crhr1, upstream G 23000899 R 23,943,068 5:23943044-23943092:+ -1.2 Mb C
CN0011 zebrafish, gria3a, intron G 23360964 R 25,097,470 5:25097454-25097473:+ -37 bp No C
TN0033 zebrafish, hey2 G 21822241 R 25,097,507 5:25097483-25097532:- 0 (Centered)
ZN0141 zebrafish, hey2 G 21822241 R 25,097,508 5:25097492-25097524:- +1 bp C
CN0001 zebrafish, tia1l, intron-exon G 23360964 R 26,185,777 5:26185761-26185780:- +1.1 Mb C
ZN0017-T011 zebrafish, - G 20843781 R 30,608,544 5:30608532-30608557:+ +5.5 Mb Low C
ZN0156 zebrafish, dab2 G 21937602 R 33,964,519 5:33964507-33964531:+ +8.9 Mb Low C
ZN0190 zebrafish, dab2ipb G 22543349 R 35,351,600 5:35351588-35351613:+ +10.3 Mb C
TN0162 zebrafish, ryr3 G 22916025 R 43,900,913 5:43900886-43900940:+ +18.8 Mb Multi-mappingC



Legends
Currently centered EEN
Multiple designed target site of the centered EEN
EEN reported with low or no activity
123 bpEEN with a distance <1 kb to the centered EEN
-45.6 kbEEN with a distance 1 kb - 1 Mb to the centered EEN
78.9 MbEEN with a distance >1 Mb to the centered EEN
GSearch EENdb with this gene symbol
RSearch EENdb with this reference
CCenter with this EEN

©2012-2013  PKU Zebrafish Functional Genomics Group
School of Life Sciences, Peking University, Beijing, China
Reference of EENdb    Contact us