EENdb - TALEN/ZFN > Chromosome View

EENs targeting zebrafish Chromosome 20

2 MbTALENsZFNsCRISPR/CasCurrently centered EEN (TN0013)


EEN IDSpecies & LocusRef.LocationLocation detailDistanceEffic.NotesCentering
ZN0035 zebrafish, hif1ab G 19198653 R 20,403,261 20:20403249-20403273:- -19.2 Mb C
TN0152 zebrafish, hif1ab, exon-intron G 22684503 R 20,414,270 20:20414244-20414296:- -19.2 Mb C
TN0151 zebrafish, fh G 22684503 R 20,427,319 20:20427293-20427345:- -19.2 Mb C
ZN0182 zebrafish, kiaa0586 G 22028029 R 39,615,304 20:39615291-39615317:- -37 bp C
ZN0109 zebrafish, eif2c1 G 21151135 R 39,615,336 20:39615324-39615349:- -5 bp C
TN0013 zebrafish, hey2 G 21493687 R 39,615,341 20:39615314-39615368:- 0 (Centered)
ZN0036 zebrafish, hey2 G 19198653 R 39,615,663 20:39615651-39615676:- +322 bp C
TN5024 zebrafish, snx11 G Zhang Group 39,615,893 20:39615867-39615920:- +552 bp Low C
CN0014 zebrafish, gata4 G Xiong & Xi group 53,601,861 20:53601846-53601864:+ +14.0 Mb C



Legends
Currently centered EEN
Multiple designed target site of the centered EEN
EEN reported with low or no activity
123 bpEEN with a distance <1 kb to the centered EEN
-45.6 kbEEN with a distance 1 kb - 1 Mb to the centered EEN
78.9 MbEEN with a distance >1 Mb to the centered EEN
GSearch EENdb with this gene symbol
RSearch EENdb with this reference
CCenter with this EEN

©2012-2013  PKU Zebrafish Functional Genomics Group
School of Life Sciences, Peking University, Beijing, China
Reference of EENdb    Contact us